为加强应用技术研究，适应上海新一轮发展的需要，受上海科学院的委托，上海市中国工程院院士咨询与学术活动中心于2003年9月17日在科学会堂思南楼组织召开了“上海应用技术研究战略”专题研讨会，院士中心主任翁史烈院士主持了会议。来自上海交大、同济大学以及相关单位的院士与专家共10多人出席了会议。
　　会上，院士、专家听取了上海科学院祝伟敏副院长的“关于组建上海应用技术研究机构(院)的建议”主题报告。报告认为上海在新世纪面临机遇和挑战，为加快实现上海社会和经济发展，根据上海科技创新体系的战略布局，上海要成为知识产生的中心和知识服务的中心，要成为高新技术产业化基地，建议组建上海应用技术研究院。
　　按照江泽民同志提出的“要瞄准世界发达国家先进水平，奋发努力，力争实现生产力跨越式发展，率先基本实现现代化”要求，与会院士、专家对上海应用技术研究战略，以及该战略在上海经济发展中的地位，展开了热烈讨论，仁者见仁，智者见智，最后专家们认为：
　　1.未来几年，上海将根据市场需求变化，依据产业综合优势，大力发展信息、金融、商贸、汽车、成套设备、房地产六大支柱产业，走新型工业化道路，从而实现到2007年上海人均GDP达到7000美元的目标。在一定发展阶段，社会变革往往取决于技术的变革，没有强大的先进的应用技术作为后盾，经济目标的实现是难以想象的。过去几年，在科技体制改革的推动下，我国应用技术研究所部分进入企业，部分转变为企业，在技术与经济结合上走出了重要的一步。但从下一步发展形势看，结合我国经济发展需要，在重大关键技术领域组建一些以发展应用技术为主的研究院是必要的，这种研究机构不以追求利润最大化为目标，而是按国家整体规划在某些重大技术领域实现强行突破为目的。
　　2.应用技术研究院的建设，要根据上海经济和社会发展战略的需求，遵循应用技术研究的发展规律，采用新机制，高起点，核心是组织和功能问题。(1)应用技术研究院组织构架以实体组织与网络单位相结合；(2)应用技术研究院的研究工作面不宜过宽，要选择有条件、有基础的领域，结合国家、地方重大、重点工程建设的需要，克服利益冲突，对战略性目标组织力量攻关。创立上海品牌，也应在产业政策、法规方面向政府提供咨询；(3)应用技术研究院要总结产学研工作的成功的经验，探索科技成果高效转化的途径；(4)应用技术研究院应是由政府规划扶持、市场机制引导的非赢利性机构。