8月26日上午，中国工程院和北京市政府经过友好协商，在北京市政府北楼第一会议室正式签署全面合作协议并召开全面合作委员会第一次会议。中共中央政治局委员、北京市委书记贾庆林，中国工程院院长徐匡迪，北京市市长刘淇出席了会议。工程院方面出席会议的还有副院长邬贺铨、刘德培、杜祥琬、沈国舫，院士王永志、陈良惠、汪燮卿、朱建士、傅熹年、殷瑞钰，秘书长常平、副秘书长白玉良等，北京市方面出席会议的还有副市长林文漪、刘海燕、刘志华，秘书长黄承祥等。会议由北京市刘海燕副市长主持。
会议首先由北京市政府秘书长黄承祥、中国工程院秘书长常平分别宣读了院、市全面合作委员会组成人员名单、《北京市人民政府中国工程院全面合作协议》和《北京市人民政府中国工程院2002-2003全面合作计划》，提请会议审议并得到通过。
随后刘淇市长、徐匡迪院长、贾庆林书记分别作了重要讲话。刘淇市长在讲话中谈到，在北京发展首都经济和建设现代化国际大都市的进程中，工程院发挥了多学科、跨部门、跨行业的综合优势，积极参与了北京的一些重大决策、重大工程和高新技术产业发展战略的研究与咨询工作。院士们以高度的责任感，渊博的知识，高水平的决策咨询能力和无私奉献的精神为北京建设做出了贡献。刘淇市长在讲话中希望工程院的院士们，能以这次双方签订协议为契机，更多地了解和关注北京，采取多种方式和渠道，全面参与北京经济发展、科技创新、城市建设和社会进步等各项事业。
徐匡迪院长在讲话中首先介绍了工程院院士在学科专业、地域等方面的分布情况，以及为首都建设已做的一些工作。随后他谈到，在今后的合作当中，将着重从大气污染的治理、高新技术产业发展、提高北京的现代制造业水平和科技奥运四个方面开展工作，为首都经济建设和科技进步做出更大的贡献。
贾庆林书记在讲话中谈到，北京市要实现"新三步走"的战略部署，实现北京市第九次党代会提出的今后五年的奋斗目标和战略任务，就必须更加倚重首都科技人才优势，更加倚重于中国工程院这样的高智力群体。市院签署全面合作协议，无疑为北京的建设和发展注入了新的动力对北京经济的发展将产生重要而深远的影响。贾书记在讲话中强调，北京市的各个机构和部门，都要积极主动地采取各种方式与工程院建立联合互动的关系，在今后计划或规划的制定、重大项目的实施过程中要充分听取院士们的意见或建议，通过双方的共同努力，形成信息共享、成果共享、互利双赢的发展格局。
会议最后，中国工程院副院长邬贺铨、北京市副市长林文漪分别代表双方签署了合作协议。中国工程院和北京市政府全面合作地正式拉开了序幕。