九龙江是福建省第二大江，是福建南部的母亲河，著名的“龙江精神”就诞生于此，为龙岩、厦门、漳州的饮用水源地，并担负着为金门地区供水的重任。由于经济的发展，九龙江流域受到一定程度的污染，2009年4月18日至19日，著名水文专家，中国工程院院士卢耀如教授一行莅临九龙江流域，现场调研污染情况及已采取的治污措施，为下一阶段九龙江流域的全面治理展开前期工作。
　　卢耀如院士在省环保局、国土厅、省科协的陪同下先后来到了漳平市污水处理厂、漳平市化肥厂、双洋吴文琴养殖场、西园伟晟养殖场、合溪电站、白沙生物发酵零排放猪场、红纺科佳治理模式养猪场、铁山养猪场拆除点，以及厦门饮用水取水口进行考察。并与龙岩市领导和环保局、农业局、畜牧水产局、发改委、国土资源局、水利局及厦门、漳州市环保局、发改委进行了充分的交流。
　　经过调研，初步了解到九龙江流域污染现状。一是九龙江流域生猪存栏约500万头以上，按一头猪等于五个人的排放量计算，相当于一个2500万人口的大型城市污水排放量，而且能够达到生态型零排放的猪场相对较少。污染物直接排放九龙江是九龙江污染的第一个突出问题。建议应在九龙江北溪流域沿岸划定畜禽养殖区和禁养区。同时，采用“猪—沼—林（菜）”，“猪—沼—草—猪”或发酵猪舍等生态型零排放模式，彻底消除畜禽养殖污水直排九龙江北溪现象。二是九龙江流域干流、支流各类型水电站有104座，平均每5公里江面就有一座水电站，造成九龙江的河流湖泊化，密度过大的水电站对水流水质自然净化产生严重影响，平静的电站库区也为藻类繁殖营造了良好的环境。建议严格禁止审批新建水电站，对已建水电站应进行一次集中清理整治，当流量小于一定量时，沿江所有水电站应停止发电，24小时开闸放水。
    三是目前九龙江沿岸各县（区）城镇生活污水处理率不高，应抓紧建设九龙江沿江县（区）城镇生活污水处理厂。建立城镇生活垃圾集中收集转运和无害化处置机制，彻底消除城镇生活污水、生活垃圾直排九龙江现象。四是九龙江沿岸工业区发展迅猛，对有氨氮、总氮、总磷排放的生产企业，应加以限制、限批，防止工业污水排入九龙江。五是由于过度采伐，九龙江流域水土流失现象严重，水源涵养林的破坏使得枯水期拉长，上游来水不足。杜绝以林木改造的名义种植巨尾桉等经济林木，重新核定涵养林。六是控制农药化肥使用，减少农业面源污染。建议可以利用畜禽养殖粪便，集中收集处置生产生物有机肥逐步取代化肥的使用。
　　九龙江流域污染治理的问题是个综合治理的问题，上游应顾全大局，下游受益地域应做出相应的补偿（资金补偿、技术补偿等）。（沙中然）